Karierę rozpoczął na początku lat 90. Pracował w radiu RMF FM, od 1996 roku prowadził programy informacyjne w Telewizji Wisła w Krakowie. W 1997 rozpoczął prace w TVN. Na początku jako reporter krajowy, później producent informacji zagranicznych. Jest autorem magazynu „Fakty Ludzie Pieniądze” oraz „Firma”. Był współautorem i współprowadzącym weekendowych wydań Faktów TVN. Współtworzył kanał TVN24, w lutym 2001 r. został szefem redakcji biznesowej. Od początku istnienia stacji prowadził programy biznesowe ("Biznes i gospodarka" oraz "Bilans"). Jest twórcą TVN CNBC, Dyrektorem i Redaktorem Naczelnym kanału.

Roman Młodkowski jest laureatem wielu nagród, między innymi trzykrotnie otrzymał nagrodę Ogólnopolskiego Przeglądu Form Dokumentalnych „Bazar” (1999r. w kategorii "najlepszy magazyn ekonomiczny", 2005r. - za magazyn "Firma", 2006r. w kategorii publicystyka). Za program „Fakty Ludzie Pieniądze” otrzymał nagrodę Czytelników Gazety Prawnej 2000, za cykl magazynów „Bilans” nagrodę w konkursie im. Władysława Grabskiego. Jest laureatem nagród: im. Dariusza Fikusa za rok 2005 w kategorii "twórca mediów", Kisiela 2006 w kategorii "publicysta", Grand Press 2006 w kategorii "dziennikarstwo specjalistyczne", Wektor 2007 przyznanej przez Konfederację Pracodawców Polskich za dziennikarską rzetelność, wiedzę i niestrudzoną popularyzację zasad wolnego rynku oraz ekonomicznego rozsądku oraz nagrody specjalnej BCC - Ostre Pióro 2007.